《無主之戰》講述了明朝中期皇帝在內閣和東廠的脅迫下不能上朝理政，以東廠太監張鯨為首的宦官集團和內閣首輔大臣王佐為首的內閣集團爭權奪勢，錦衣衛大總管趙崇禧夾在兩派中間保持中立，堅持忠于皇上，可是錦衣衛早已被兩派安插了多名內奸。一場明著發生在錦衣衛南北鎮府司之間，背地里宦官和內閣之間的爭斗開始展開。